Касуми Фуу - молодая и неуклюжая официантка, мирно работающая в маленькой чайной. По крайней мере, так было, пока она случайно не облила одного из посетителей. Спасаясь от агрессивно настроенных самураев, она призывает на помощь другого клиента, Мугэна, который быстро побеждает напавших с помощью безумной техники боя, смутно напоминающей брейк-данс. Увы, но потом Мугэн решает сразиться с Дзином, который, несмотря на нежелание драться, оказывается достойным противником, владеющим гораздо более точным и традиционным стилем фехтования. Но проблема не в этом, а в том, что они разругают все заведение и случайно убивают сына судьи. За такие преступления самураев должны казнить, но Фуу спасает их и…

Сюжет сосредоточен на Уки, имперской наложнице, которая никогда не посещала покои императора, скрытая ото всех в гареме. Некоторые считают ее похожей на старуху, другие - на молодую леди. Известно, что она использует таинственную магию, которая помогает ей во всем: от поиска потерянных вещей до наложения проклятий. Когда обстоятельства заставят императора обратиться к ней, их встреча изменит историю.

Япония, середина XIX века. Конец многовековой изоляции, период бурь и потрясений, последние годы сегуната Токугава. Столкновение западного опыта и восточной мудрости взволновало умы и привело к рождению новых идей – порою весьма опасных. Это в полной мере испытал на себе Кодо Юкимура – известный целитель, прошедший обучение у голландских специалистов. После очередного приглашения в столицу доктор Юкимура таинственно исчез. Его дочь Тидзуру, не в силах вынести неизвестность, переоделась юным самураем, взяла фамильный меч-кодати и отправилась в Киото на поиски отца. В первую же ночь столичной жизни Тидзуру стала свидетелем жестокой схватки двух групп самураев. Победители взяли ее в плен, и каково…

Первый сезон «Цветных Облаков» перетекает во второй исключительно плавно: Сюрэй возвращается в столицу в надежде «продавить» указ об организации научно-исследовательской базы в Коричневой провинции; Его Величество поглощен государственными делами (прилично для «соломенного вдовца»... и хоть какое-то занятие!); семья Ко интригует, надеясь подыскать Сюрэй самого престижного и перспективного мужа; а тем временем под небом Цветных Облаков сгущаются тучи в виде загадочных эпидемий, тревожных предзнаменований и появления дьявольски-прекрасного Сеньи Лина...